Сбежать из тюрьмы "Фокс Ривер" - оказалось самым простым из того, что пришлось совершить беглецам. Теперь, Майклу Скофилду придется драться за свою жизнь в федеральной тюрьме Панамы - "Сона", где действует одно правило - сила, и выйти из которой можно только в мешке для трупов. Линкольн Бэрроуз вынужден организовывать новый побег для своего брата, а также одного из заключенных, которого им нужно взять с собой, так как "Компания" взяла в заложники Линкольна - младшего.
В Третьем Сезоне время работает против героев, и в этот раз кажется, что выхода нет!